隨著癌癥研究的不斷深入，融合基因被認為是癌癥發生的主要原因之一。而快速準確地對融合基因進行檢測，則能夠指導醫學的研究方案選擇。然而，目前存在的分子檢測方法在分辨率和通量方面受到一定的限制。而靶向RNA-seq技術，通過使用生物素化寡核苷酸探針來富集目標RNA轉錄本，能夠克服這些限制，實現對融合基因的敏感檢測。

傳統的融合基因檢測方法主要包括Fluorescence in situ hybridization（FISH）和實時定量聚合酶鏈反應（RT-PCR）。然而，這些方法只能檢測單個融合基因，無法識別新的融合基因伴侶或解析復雜的結構重組。而靶向RNA-seq技術可以克服這些限制，其敏感度高，能夠檢測到罕見或較低表達的轉錄本。

靶向RNA-seq的優勢在于能夠在一個實驗中靶向捕獲數百個基因，大大提高了融合基因的檢測率。通過對多個細胞系進行檢測分析，該技術在檢測融合基因方面表現出更強的優勢。例如，在肺癌患者的腫瘤組織中，靶向RNA-seq不僅確認了ROS1和ALK的重組現象，還確定了其伴侶基因和融合連接位點。這不僅提高了融合基因的檢測率，還與之前的檢測結果具有高度的一致性。

另外，靶向RNA-seq技術還應用于其他疾病的融合基因檢測。在慢性髓性白血病者中，靶向RNA-seq確定了與imatinib研究反應相關的BCR-ABL1異構體。在前列腺癌者中，靶向RNA-seq識別到了多個TMPRSS2-ERG融合異構體，并發現這些融合異構體具有多樣的轉錄起始位點。此外，靶向RNA-seq還可以用于統計基因和外顯子的表達，通過讀深變化來識別融合連接位點，并發現融合基因的發生可能與基因表達相關。

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