GFP抗體在蛋白質標記應用中的常見問題

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GFP適合于蛋白質標記，這是該抗體的天然優勢。雖然它非常適合實時成像，例如，作為 TP53 MITE-seq 屏幕的報告器，其他應用導致 GFP 熒光猝滅，這使得有必要使用抗 GFP 抗體。組織樣本的冷凍保存、組織學制備和固定劑的使用通常會導致 GFP 熒光*或部分喪失，因此需要使用抗 GFP 抗體來獲得可靠的結果。

通過蛋白質印跡檢測 GFP 標記的蛋白質和通過免疫沉淀研究蛋白質 -蛋白質相互作用也需要使用 GFP 抗體。抗GFP抗體可用作多克隆或單克隆抗體，適用于在蛋白質印跡、免疫沉淀、免疫組織化學、免疫細胞化學定位和免疫吸附測定 (ELISA) 上檢測 GFP、GFP 變體和 GFP 融合蛋白。

GFP的分子結構與特征
GFP 形成一個比較穩定的桶形結構，由圍繞中央 α 螺旋的 11 個 β折疊組成。β 表通過富含脯氨酸的環連接。每個片層中的氨基酸側鏈交替突出到蛋白質內部或從表面向外突出。GFP 發色團由 Ser65、Tyr66 和 Gly67 的分子內環化形成，它幾乎位于環 的中心。盡管這三個氨基酸基序在自然界中很常見，但它不會產生熒光。

正是 GFP β-*的內部環境產生了發色團并保護它免于猝滅。發色團的形成是自催化的。GFP 以 Max激發波長為 395 nm 的主要質子化狀態和具有 475 nm 激發峰的不那么普遍的非質子化狀態存在。兩種形式的熒光發射均在 510 nm 處達到峰值。

抗 GFP 抗體是否也識別 GFP 的變體？
抗 GFP 抗體可識別 Aequorea victoria GFP 的其他變體。
為什么在蛋白質印跡上沒有抗 GFP 抗體的信號？

蛋白質印跡后缺乏信號可能表明存在一些不同的問題。沒有或非常差的傳輸意味著沒有信號。可以通過 Ponceau-S 染色檢查缺乏良好的膜轉移。氣泡的存在也會導致轉印不良。GFP 標記蛋白的表達水平可能太低。加載更大體積的樣品并包括陽性對照。非常稀釋的抗體可能是問題所在，嘗試使用幾種不同濃度的抗體來探測蛋白質印跡。此外，一種遙遠的可能性是 GFP 標簽超出幀并且未表達，導致缺少任何信號。

GFP信號太弱無法成像，可以增強信號嗎？
在某些實驗條件下，GFP 熒光會部分或*丟失。因此，一些表達 GFP 標記蛋白的細胞結構可能難以可視化或成像。 GFP-Booster 是一種源自駱駝科動物的 VHH 結構域結合蛋白，與強熒光染料偶聯。這穩定并增強了熒光信號。

為什么用抗 GFP抗體進行免疫沉淀后會觀察到多個條帶？
抗體交叉反應是一個常見問題，通常會導致比預期更多的條帶。更嚴格的實驗條件可能會解決這個問題。GFP-Trap 可用于免疫沉淀實驗。GFP-Trap 是一種單域抗體（源自駱駝科動物），具有更高的特異性、穩定性和親和力。然而，必須考慮到，如果產生了截短的融合蛋白，如果存在標簽，這些也將被抗體檢測到，并導致多個條帶。